Собор Эстонской Православной Церкви состоится в Пюхтице
Высшим органом, при содействии которого Предстоятель ЭПЦ МП, Высокопреосвященный митрополит Таллиннский и всея Эстонии Корнилий, управляет Церковью, является Собор ЭПЦ МП. Собор осуществляет высшую законодательную, административную и контролирующую власть. В Собор входит все духовенство ЭПЦ МП (исключая заштатных и запрещенных в служении), а также по одному представителю от мирян, избираемых от каждого прихода. Собор созывается не реже одного раза в год.